Атф нуклеотид: АТФ и другие органические соединения клетки

Содержание

Нуклеиновые кислоты. АТФ. Нуклеотид и его компоненты

Ст. 62

Рассмотрите рис. 37 и 38. Какие химические элементы входят в состав нуклеотидов нуклеиновых кислот?

Кислород, водород, натрий, углерод, фтор.

Ст. 67

Вопросы и задания

1. Что такое нуклеотид? Из каких компонентов он состоит? Какие части нуклеотида составляют остов цепи нуклеиновых кислот?

группа органических соединений, представляют собой фосфорные эфиры нуклеозидов. Нуклеотид состоит из остатка фосфорной кислоты, углевода – моносахарида (рибозы в РНК или дезоксирибозы в ДНК) и азотистого

основания. Таким образом, остов молекул нуклеиновых кислот составляют пентозы, между которыми образуются фосфодиэфирные мостики (по сути остатки пентоз и фосфорных кислот чередуются).

2. Что собой представляют молекулы нуклеиновых кислот? Чем нуклеиновые кислоты как полимеры отличаются от белков?

В зависимости от химической структуры углеводного компонента нуклеиновые кислоты делят на два типа: дезоксирибонуклеиновые и рибонуклеиновые; первые содержат дезоксирибозу, а вторые – рибозу. Азотистые основания являются производными двух типов соединений – пуринов и пиримидинов. Основаниями они называются потому, что обладают основными (щелочными) свойствами, хотя и слабыми. В составе ДНК встречаются два пуриновых – аденин (А) и гуанин (G) и два пиримидиновых – цитозин (С) и тимин (Т) основания. В составе РНК вместо тимина обычно встречается урацил (U). Согласно правилам международной номенклатуры эти основания записываются начальными буквами их названий на английском языке, хотя в русскоязычной литературе часто используются начальные буквы русских названий; соответственно А, Г, Ц, Т и У. Белки и нуклеиновые кислоты (ДНК и РНК) – биополимеры. Их главное различие в составе. Мономерами белков являются аминокислоты, а мономерами нуклеиновых кислот – нуклеотиды. В состав природных белков входит 20 разновидностей аминокислот, а в состав нуклеиновых кислот – 5 разных нуклеотидов.

3. Используя буквенные обозначения нуклеотидов, составьте 2–3 варианта фрагментов цепей ДНК и РНК, построенных из 10 мономеров. В чём проявляется специфичность этих фрагментов? Какое это имеет значение?

— Днк: АГТЦТААГГЦ

ТЦАГАТТЦЦГ

РНК: АГУЦУААГГЦ

— Днк: ТАГЦЦГАТГЦ

АТЦГГЦТАЦГ

Рнк: УАГЦЦГАУГЦ

ДНК в клетке выполняет исключительно важную функцию – хранит и передаёт наследственную информацию. Количество молекул ДНК и их нуклеотидная последовательность являются генетическим признаком вида и специфичны для каждого организма.

4. Назовите пары комплементарных азотистых оснований. Какие связи образуются между ними? Возможно ли иное попарное соединение азотистых оснований? Ответ проиллюстрируйте примерами.

А=Т, Г=Ц, А=У. Между ними образуются водородные связи. Иное попарное соединение невозможно.

5. В чём состоит основное различие в строении ДНК и РНК?

Строение ДНК. Молекула ДНК состоит из двух спирально закрученных полинуклеотидных цепей, причём каждая спираль закручена вправо, и обе они свиты вместе, т. е. закручены вправо вокруг одной оси.

Молекулы РНК состоят из одной полинуклеотидной цепи, которая может иметь прямые и спиральные участки, образовывать петли (также за счёт водородных связей)

6. Какие виды РНК вам известны? Какие функции они выполняют?

Информационная, или матричная, РНК (иРНК, мРНК) переносит инфор — мацию о первичной структуре белка от ДНК к рибосомам.

Транспортная РНК (тРНК) – это самая короткая молекула, состоящая из 70–80 нуклеотидов. Они транспортируют аминокислоты к месту синтеза белка – на рибосомы.

Рибосомалъные РНК (рРНК) строят тело рибосомы. Они составляют более 80% всей массы РНК в клетке. Синтезируются рРНК на участках ДНК хромосом, расположенных в ядрышковом центре ядра. Они связываются с белками и строят тело рибосомы.

7. Сравните два вида нуклеиновых кислот. Перечертите в тетрадь и заполните таблицу.

Строение и функции нуклеиновых кислот

8. Роль АТФ в клетке можно сравнить с ролью батарейки или аккумулятора. Объясните, в чём заключается это сходство.

Клетка использует эту запасённую энергию для осуществления различных процессов: создания собственных органических веществ, движения, деления, передачи нервных импульсов и т. д. АТФ мобилен и способен доставлять энергию в любую часть клетки. Он является ключевым веществом клеточных обменных процессов и универсальным источником энергии.

9. Как называют энергетически богатые связи? Может ли в одной реакции идти гидролиз одновременно по двум таким связям? Назовите вещества, образующиеся при гидролизе АТФ с отщеплением: а) одной молекулы фосфорной кислоты, б) двух молекул фосфорной кислоты. Напишите в тетрадях уравнения гидролиза.

Богатые энергией химические связи в молекуле АТФ называются макроэргические. Нет, не может.

При отделении одного остатка фосфорной кислоты АТФ переходит в АДФ (аденозиндифосфорную кислоту), если отделяется еще один остаток фосфорной кислоты, то АДФ переходит в АМФ(аденозинмонофосфорную кислоту), что бывает крайне редко. Место отделившегося остатка фосфорной кислоты занимает молекула воды. Отделение каждого остатка фосфорной кислоты происходит с помощью ферментов, при этом выделяется 40 кДж (а при разрыве обычных ковалентных связей – около 12 кДж энергии).

Уравнение:

10. Закончите заполнять в тетрадях таблицу «Химический состав клетки» (см. с. 41). Внесите в неё сведения о нуклеиновых кислотах и АТФ.

УЛЬТРАСНАП (ULTRASNAP) тест для определения АТФ на поверхности

Поиск по каталогу

Каталог товаров / Контроль гигиены / система HACCP

Люминометр SystemSURE принцип работы.

pdf
365.8 кб, 07 ноября в 17:50
Презентация Быстрые методы гигиенического мониторинга АТФ-люминометрия.ppt
2.3 Мб, 18 октября в 14:30

Оформить заказ

Ultrasnap для определения АТФ на поверхности.

Высокая чувствительность: Обнаружение 0.1-1 фемтомолей АТФ
- Для обнаружения АТФ до 0.1 фемтомолей, используйте EnSURE
- Для обнаружения АТФ до 1 фемтомолей, используйте SystemSURE

Срок хранения:

15 месяцев в холодильнике (при температуре 2-8°C)
4 недели при комнатной температуре (21-25°C)

Совместимые люминометры

EnSURE
SystemSURE Plus

АТФ-ТЕСТ ДЛЯ ПОВЕРХНОСТЕЙ

Данный тест дает количественный анализ о наличие плесени, дрожжей, микроорганизмов и остатков продукции.

Одноразовый экспресс-тест Ультраснап поставляется в упаковках по 100 штук.

UltraSnap – универсальный АТФ-тест, используемый с люминометрами Hygiena. Этот индикаторный тест, размером с пишущую ручку, отличается удобством использования, компактностью и экологической безопасностью. Кроме того, в тесте UltraSnap используется уникальный жидкий стабильный реагент, который обеспечивает превосходную точность, стабильность свечения и высокую воспроизводимость результатов.

При взаимодействии АТФ с реагентами Ultrasnap Total происходит выброс квантов света,

которые фиксируют приборы: SystemSure Plus и EnSure.

Преимущества:

Сокращение до 50% расходов, по сравнению с использованием АТФ-тестов других производителей
Получение результатов за 15 секунд
Воспроизводимость и точность результатов

Предувлажненный тампон
Жидкий стабильный реагент
Ярлыки для маркировки пробирок – быстрая идентификация проб
Экологическая безопасность – содержание пластиковых компонентов ниже на 20 … 80%, по сравнению с тестами других производителей
Запатентованная технология Snap-Valve™ – закройте пробник, выдавите реагент: все просто!
Воспроизводимость результатов и точность, не знающие аналогов
Устойчивость к нарушениям температурного режима
Возможность тестирования влажных и сухих поверхностей

Полная продолжительность анализа составляет всего 30 секунд.

Что такое АТФ-тестирование?

Аденозинтрифосфат, или АТФ, – нуклеотид, участвующий в обмене энергии и веществ в организме. Он присутствует во всех живых клетках, а, значит, является идеальным индикатором чистоты или загрязнения поверхности. Производители продуктов питания и напитков по всему миру используют аналитические системы для мониторинга АТФ, что позволяет быстро подтвердить надлежащее качество очистки поверхностей, исключает вероятность загрязнения новой производственной партии остаточными микроорганизмами и бактериями, и препятствует образованию на поверхностях биопленок, ухудшающих качество конечных продуктов.

При использовании систем АТФ-мониторинга для контроля гигиены (также называемых АТФ-системы санитарного контроля), АТФ вступает в реакцию с уникальным жидким стабильным реагентом Hygiena, который содержится в индикаторных тестах. В результате происходит излучение света, интенсивность которого прямо пропорциональна количеству АТФ, присутствующему в пробе. Таким образом, за считанные секунды Вы получаете данные о степени загрязнения.

Начинайте каждый рабочий день с контроля гигиены.

Чистая производственная среда – залог производства безопасных и качественных продуктов питания. Интеграция методов АТФ-мониторинга в процедуры предоперационного контроля оборудования и контроля на разных этапах производства позволяет квалифицированным специалистам осуществлять проверку гигиены оборудования за считанные секунды. Гигиена оборудования зависит от того, когда Вы начнете ее мониторинг, поэтому лучше всего – начать незамедлительно!

Возьмите пробу, закройте пробник, выдавите реагент. Все очень просто!

UltraSnap отличается максимально простым использованием. Вся процедура включает всего три этапа: возьмите пробу, активируйте тест и смешаете пробу с реагентом. С этим справится даже не опытный пользователь. Ознакомьтесь с видео руководством по использованию.

Жидкий стабильный реагент.

UltraSnap содержит жидкий стабильный реагент в запатентованном легко активируемом клапане Snap-Valve™. Сочетание уникального реагента и дизайна теста исключает необходимость регидрации гранул непосредственно перед использованием (как в случае с сублимированными реагентами), что обеспечивает воспроизводимость и точность результатов.

Также в продаже

ATP — Solid, NTP Solids

Аденозин 5′-трифосфат, тригидрат динатриевой соли

MSDS (PDF) Спецификация (PDF)

Кат. №	Сумма	Цена (евро)	Купить/Примечание
НУ-1010-1Г	1 г	28,30	Добавить в корзину/Цитировать Добавить в Блокнот
НУ-1010-10Г	10 г	113,50	Добавить в корзину/Цитировать Добавить в Блокнот
НУ-1010-100Г	100 г	453,90	Добавить в корзину/Цитировать Добавить в Блокнот

Структурная формула АТФ — Твердый

Для общелабораторного использования.

Доставка: поставляется в гелевых упаковках

Условия хранения: хранить при -20 °C
Возможно кратковременное воздействие (в совокупности до 1 недели) при температуре окружающей среды.

Срок годности: 12 месяцев с даты поставки

Молекулярная формула: C ₁₀ H ₁₆ N ₅ O ₁₃ P ₃ (свободная кислота)

Молекулярный вес: 507,18 г/моль (свободная кислота)

Точная масса: 507,00 г/моль (свободная кислота)

CAS#: 51963-61-2

Чистота: ≥ 98 % (ВЭЖХ)

Форма: лиофилизированный

Спектроскопические свойства: λ _макс. 259 нм, ε 15,1 л ммоль ^-1 см ^-1 (Трис-HCl pH 7,0)

Применение:
АТФ-чувствительные кальциевые каналы ^[1]
V-АТФазы (клеточные протонные насосы) ^{[2] 901 15
АТФ-соединение ремоделирование хроматина ^[3]
АТФ-связывающие кассетные переносчики ^[4]
АТФ-захватывающие ферменты ^[5]
Агонистический лиганд, главным образом для нуклеозидного рецептора А ₁
Клеозиды действуют как нуклеозиды лиганды рецепторов.}

Специфические лиганды:

Лиганд для пуринергических рецепторов:
P2X ₁ -P2X ₃ ^{[6,7] 901 15
P2X _1/4^[8]
P2X ₄ ^[7]
P2X ₇ ^[9,10,11]
P2X ₁ — P 2X ₇ ^[12]
P2Y ₁ ^[10,14]
P2Y ₂ ^[13,14]
P2Y ₁₁ ^[14]}

BIOZ Product Citations:
Щелкните стрелку справа, чтобы развернуть список ссылок. Нажмите на название публикации, чтобы увидеть полный текст.

Выбранные ссылки:
[1] Ван и др. (2011) Биологическое действие эндогенного диоксида серы на сердечно-сосудистую систему. евро. Дж. Фармакол. 670 (1) :1.
[2] Скотт и др. (2011) Дуэльные функции V-АТФазы. EMBO J. 30 (20) :4113.
[3] Erdel и др. (2011) Ремоделирование хроматина в клетках млекопитающих комплексами типа ISWI — где, когда и почему? FEBS J. 278 (19) :3608.
[4] Gatti и др. (2011) Новое понимание нацеливания на АТФ-связывающие кассетные переносчики для противоопухолевой терапии. Курс. Мед. хим. 18 (27) :4237.
[5] Фаваз и др. (2011) Ферменты захвата АТФ. Биоорг. хим. 39 (5) :185.
[6] Lambertucci и др. (2015) Медицинская химия рецепторов P2X: агонисты и ортостические антагонисты. Курс. Мед. хим. 22 (7) :915.
[7] Ralevic (2015) Рецепторы P2X в сердечно-сосудистой системе и их потенциал в качестве терапевтических мишеней при заболеваниях. Курс. Мед. хим. 22 (7) :851.
[8] Harhun и др. (2014)Вызванные АТФ устойчивые вазоконстрикции, опосредованные гетеромерными рецепторами P2X1/4 в церебральных артериях. Ход 45 (8) :2444.
[9] Фаччи и др. (2014) Toll-подобные рецепторы 2, -3 и -4 инициируют микроглию, но не астроциты в областях центральной нервной системы для АТФ-зависимого высвобождения интерлейкина-1β. науч. Рем. 4 :6824.
[10] Штольц и др. (2015) Гомодимерный аноктамин-1, но не гомодимерный аноктамин-6, активируется увеличением содержания кальция, опосредованным рецепторами P2Y1 и P2X7. Pflugers Archive DOI:10.1007/s00424-015-1687-3.
[11] Лорд и др. (2014) Фармакология нового проникающего в центральную нервную систему антагониста P2X7 JNJ-42253432. J. Pharmacol. Эксп. тер. 351 (3) :628.
[12] Дал Бен и др. (2015) Пуринергические рецепторы P2X: структурные модели и анализ взаимодействия лиганд-мишень. Евро. Дж. Мед. хим. 89 :561.
[13] Се и др. (2014) Рецептор нуклеотидов P2Y2 опосредует пролиферацию и миграцию клеток гепатоцеллюлярной карциномы человека, индуцированную АТФ. Дж. Биол. хим. 289 (27) :19137.
[14] Ким и др. (2002) Метанокарбовая модификация урациловых и адениновых нуклеотидов: высокая активность конформации северного кольца в рецепторах P2Y1, P2Y2, P2Y4 и P2Y11, но не в рецепторах P2Y6. J. Med. хим. 45 :208.
Волонте и др. (2009) Компоненты мембраны и пуринергическая передача сигналов: пурином, сложное взаимодействие между лигандами, разрушающими ферментами, рецепторами и переносчиками. FEBS J. 276 :318.
Егуткин (2008) Нуклеотид и нуклеозидпревращающие ферменты: важные модуляторы пуринергического сигнального каскада. Биохим. Биофиз. Acta 1783 :673.
Хаско и др. (2007) Формирование функции моноцитов и макрофагов аденозиновыми рецепторами. Фармацевтика и терапия 113 :264.
Голландия и др. (1991) Обнаружение специфического продукта полимеразной цепной реакции с использованием 5′-3′-экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы Thermus aquaticus . Проц. Натл. акад. науч. США 88 (16) :7276.
Эрлих и др. (1988) Направленная праймером ферментативная амплификация ДНК с помощью термостабильной ДНК-полимеразы. Наука 29 (239) :487.
Уильямс и др. (1986) Влияние пуриновых нуклеотидов на связывание [3H]циклопентиладенозина с аденозиновыми A1-рецепторами в мембранах головного мозга крыс. Дж. Нейрохим. 47 (1) :88.
Sanger и др. (1977) Секвенирование ДНК с помощью ингибиторов обрыва цепи. Проц. Натл. акад. науч. США 74 :5463.

NU-1001, дАТФ — Раствор
NU-1002, dCTP — Решение
NU-1003, дГТФ — Раствор
NU-1005, Комплект dNTP
NU-1006, dNTP Mix — 10 мМ раствор
NU-1008, dUTP — Раствор
NU-1101, N ⁶ -Метил-АТФ
НУ-1102, АП ₄
НУ-1103, Этено-АТФ (ε-АТФ)
NU-1115, 5-фтор-UTP

Полимеразно-амплифицированное высвобождение АТФ (POLARA) для обнаружения однонуклеотидных вариантов в РНК и ДНК

Полимеразно-амплифицированное высвобождение АТФ (POLARA) для обнаружения однонуклеотидных вариантов в РНК и ДНК†

Майкл Г.

Мохсен, ^и Дебин Цзи ^и и Эрик Т. Кул * ^и

Принадлежности автора

* Соответствующие авторы

^и Кафедра химии, Стэнфордский университет, Стэнфорд, Калифорния 94305, США
Электронная почта: [email protected]

Аннотация

rsc.org/schema/rscart38″> Идентификация однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) приобретает все большее значение для диагностики и лечения заболеваний. Здесь мы изучили потенциальное использование АТФ-высвобождающих нуклеотидов (ARN) для идентификации SNP в мишенях ДНК и РНК. Синтезированные как производные четырех канонических дезоксинуклеотидов, ARN можно использовать вместо дезоксинуклеозидтрифосфатов для удлинения праймера, гибридизованного с матрицей нуклеиновой кислоты, при этом уходящей группой является АТФ, а не пирофосфат. Высвобожденный АТФ затем используется вместе с люциферазой для генерации хемилюминесценции. Удлинение длинной целевой ДНК или РНК генерирует много эквивалентов АТФ на цепочку-мишень, обеспечивая изотермическую амплификацию сигнала. В принципе, аллель-специфические праймеры можно использовать в сочетании с ARN для генерации дифференциальных сигналов люминесценции в отношении различных генетических полиморфизмов. Чтобы проверить это, были протестированы различные конструкции праймеров, модификации, ферменты и условия, в результате чего была разработана оптимизированная стратегия, позволяющая различать разные матрицы нуклеиновых кислот с разрешением в один нуклеотид.

Рубрики

Атф нуклеотид: АТФ и другие органические соединения клетки — урок. Биология, 9 класс.

Нуклеиновые кислоты. АТФ. Нуклеотид и его компоненты