Анатомия конечностей: Анатомия вен нижних конечностей Казань

суставы конечностей. Часть 1. Суставы верхних конечностей — онлайн лекция в Колледже Вейдера

Функциональная анатомия аппарата движения: суставы конечностей. Часть 1. Суставы верхних конечностей — онлайн лекция в Колледже Вейдера

Документы: сертификат
Время обучения: 2 часа 05 минут
Лектор: Кульбах Ольга Станиславовна 2400 ₽2600 ₽*

Лекция посвящена морфофункциональному анализу основных структурных компонентов и вспомогательного аппарата крупных суставов верхних конечностей (грудино-ключичный, плечевой, локтевой, лучезапястный), анализу движений, топографии и функции мышц, которые их обеспечивают.

Содержание лекции (основные разделы):

• Основные элементы сустава
• Суставные поверхности
• Суставная капсула
• Состав синовии
• Правила здоровья суставов
• Движения в суставах
• Классификация суставов
• Суставы верхней конечности
• Соединение костей плечевого пояса между собой
• Мышцы грудинно-ключичного сустава
• Особенности плечевого сустава
• Мышцы плечевого сустава
• Локтевые суставы
• Двуглавая мышца плеча
• Плечевая мышца
• Локтевая мышца
• Супинатор
• Лучевой сгибатель запястья
• Локтевой сгибатель запястья
• Длинная ладонная мышца

Выдаваемые документы

Сертификат «Функциональная анатомия аппарата движения: суставы конечностей. Часть 1. Суставы верхних конечностей»

По окончании обучения выдаваемые документы выпускаются в электронном виде, которые можно скачать в системе дистанционного обучения. Оригиналы документов с голограммой Колледжа можно забрать в офисе в Москве или Санкт-Петербурге.
Стоимость изготовления бумажных версий сертификатов и/или дипломов с защитной голограммой Колледжа 1500₽ (за комплект). По акции в стоимость изготовления включена отправка почтой по России.

Запись доступна для просмотра 7 дней с момента оплаты.

Другие лекции преподавателя:

1. Функциональная анатомия аппарата движения: суставы конечностей. Часть 2. Суставы нижних конечностей
2. Функциональная анатомия позвоночника

Обучение в Колледже Вейдера — намного больше, чем любое обучение, это всегда гарантия качества, преподаватели высочайшего уровня, профессиональный контент, максимум полезной информации.
Преподаватели — легенды, о которых можно узнать на сайтах российских вузов и международных медицинских учреждений и спортивных федераций.

Преподаватель

Кульбах Ольга Станиславовна

Теги:  Анатомия

Дополнительные курсы:

• Mind&Body. Pilates в работе персонального тренера (онлайн)
• Mind&Body. Дыхательные упражнения (онлайн)
• Mind&Body. Йога в работе персонального тренера (онлайн)

• Mind&Body. Суставная гимнастика (онлайн)
• Как заработать с дипломом нутрициолога
• Тренер медицинского фитнеса (онлайн)
• Фейсбилдинг-специалист (онлайн)
• Кардиофитнес.
  Тренировки при заболеваниях кардиореспираторной системы (онлайн)
• Метаболический фитнес. Тренировки при заболева­ниях эндокринной системы (онлайн)
• Методики тренировок для медицин­ского фитнеса (онлайн)
• Постуральный фитнес. Тренировки при заболева­ниях позвоночника и суставов (онлайн)
• Специалист по восстановлению после различных заболеваний, COVID-19 (онлайн)
• ТМФ.Адаптация, восстановление, здоровье и безопасность (онлайн)
• ТМФ.Экономика и маркетинг медицинского фитнеса (онлайн)
• Инструктор по банджи фитнесу (онлайн)
• Прогрессивные методики миофасциального релиза (онлайн)
• Гипо- и гипергликемические состояния при занятиях фитнесом
• Гомеостаз при физической нагрузке
• Выбор физической активности с учётом гормонального статуса
• Ожирение — успех лечения зависит от многих. Ожирение как мультидисциплинарная проблема
• Физическая работоспособность. Динамика состояния организма в тренировочном процессе
• Функциональная анатомия аппарата движения: суставы конечностей. Часть 2. Суставы нижних конечностей
• Функциональная анатомия позвоночника
• Механизмы энергообеспечения мышечной деятельности
• Как мы восстанавливаемся. Биохимические аспекты восстановления
• Биологический возраст. Маркеры качества жизни
• Здоровье — образ жизни. Абсолютно новая парадигма здоровья
• От чего зависит гипертрофия мышц (параметры, определяющие объём мышц)
• Выбор стратегии восстановления после различных заболеваний
• Оценка состояния клиента.
  Выбор физических нагрузок
• Фитнес-программы и методики. Восстановление после различных заболеваний
• Питание и иммунитет
• Кожа: строение и функции
• Кожа и питание
• Лекция ФБ. Кожа и старение
• Лекция ФБ. Противопоказания. Работа с лицом при различных заболеваниях
• Лекция ФБ. Анатомо-физиологические основы старения лица
• Инструментальная мобилизация мягких тканей лица
• Лекция ФБ. Анатомо-физиологические особенности строения лица и шеи

Задать вопрос

Ждите…

clean

_

Анатомия человека.

Кости туловища и конечностей. Наглядно учебное пособие. Карточки 32 штукиАнатомия человека. Кости туловища и конечностей. Наглядно учебное пособие. Карточки 32 штуки

• Главная
• О магазине
• Доставка
• Контакты

• Бижутерия
• Канцтовары
• Посуда
• Спорт и туризм
• Хозтовары
• Швейная галантерея
• Мебель
• Игрушки
• Творчество
• Книги
• Сувениры
• Праздники
• Текстиль
• Одежда и обувь
• Авто и мото
• Летние товары
• Сад и огород
• Баня и сауна
• Детские товары
• Зоотовары
• Строительство и ремонт
• Интерьер
• Аксессуары
• Красота и здоровье
• Бытовая техника и электроника
• Собственное производство
• Оборудование для бизнеса и производства
• Освещение
• Упаковка
• Товары с любимыми героями
• Наша разработка

Связаться с нами

Диярбакыр

• clo.ru/adorable_potoo_of_wealth:images/7667385/0/700.webp»>

О товаре

• Страна производитель: Россия
• Торговая марка: ГЭОТАР-Медиа
• Артикул: 7667385
• Мин. кол-во для заказа: 1
• Возраст: от 16 лет
• Количество страниц: 32
• Год издания: 2022
• Тип обложки: твёрдый переплёт
• Автор: гайворонский алексей иванович, гайворонский иван васильевич, ничипорук геннадий иванович
• Наличие: под заказ

Все характеристики

1589 RUB P

1045 p* *при покупке от 10 шт.

под заказ

Мин 1 шт На складе 1 шт.

Добавить в корзину

Описание и характеристики

Доставка и оплата

• Страна производитель Россия
• Торговая марка ГЭОТАР-Медиа
• Артикул 7667385
• Мин. кол-во для заказа 1
• Возраст от 16 лет
• Количество страниц 32
• Год издания 2022
• Тип обложки твёрдый переплёт
• Автор гайворонский алексей иванович, гайворонский иван васильевич, ничипорук геннадий иванович
• Длина упаковки 14. 6
• Высота упаковки 1.1
• Ширина упаковки 10.5
• Объем упаковки, куб. дм 0.169
• Объем продукта, л 0.1686
• Вес, г 180
• Фасовка 1
• ISBN 978-5-9704-6284-3
• Кол-во страниц 32

Передача в доставку до 26.06.2023

(Ваш заказ будет отправлен в течение 20 рабочих дней после оплаты).

Стоимость доставки оплачивается при получении заказа.

Мы принимаем к оплате

Доставка в Диярбакыр

Популярное

«Домашний самогон, настойки, наливки и другие любимые напитки», Ивенская О. С.

1078 p

Золотая книга лидера. 101 способ и техники управления. Бальдони Д.

1066 p

Сенсация Тайна (новое издание). Берн Р.

1539 p

Жутко громко и запредельно близко

1258 p

Основа для броши, 15 мм, 1 отверстие, 10 шт, цвет серебряный

26 p

Игольница магнитная с иглами, 7 × 8 см, цвет МИКС

153 p

Набор «Эвкалипт, сосновое масло, пихта» 3 эфирных аромамасла 100% 15мл

305 p

Пистолет для полива, 6 режимов, фиксатор, под коннектор, эргономичная ручка, пластик

423 p

Сто лет одиночества

857 p

Набор чайных свечей ароматических «Ваниль», 3,8х1,6 см, 3,5 ч, 12 г, 6 штук

128 p

Атлас анатомии конечностей мыши: интерактивный 3D-инструмент для изучения формирования эмбриональных конечностей | Биология развития BMC

• База данных
• Открытый доступ
• Опубликовано: 15 сентября 2008 г.

• Эйприл Делорье ^1,2 ,
• Николас Бертон ³ ,
• Майкл Беннетт ¹ ,
• Ричард Болдок ³ ,
• Дункан Дэвидсон ³ ,
• Тимоти Дж. Мохан ¹ и
• …
• Малкольм П.О. Логан ¹  

BMC Биология развития том 8 , номер статьи: 83 (2008) Процитировать эту статью

• 40 тыс. обращений

• 1 Альтметрический

• Сведения о показателях

Реферат

История вопроса

Развивающаяся конечность мыши широко используется в качестве модельной системы для изучения тканевого паттерна. Несмотря на это, имеется несколько ссылок, которые можно использовать для правильной идентификации развивающихся структур конечностей, таких как мышцы и сухожилия. Существующие текстовые ссылки состоят из двухмерных (2D) иллюстраций конечностей взрослой крысы или мыши, которые может быть трудно применить при попытке описать сложные трехмерные (3D) отношения между тканями.

Результаты

Чтобы улучшить ресурсы, доступные в мышиной модели, мы создали бесплатный интерактивный справочник мышц конечностей, сухожилий и скелетных структур в эмбриональный день (E) 14.5 http://www.nimr. .mrc.ac.uk/3dlimb/. Атлас был создан с использованием образцов передних и задних конечностей мыши, окрашенных с использованием иммуногистохимии для обнаружения мышц и сухожилий. Конечности были отсканированы с помощью оптической проекционной томографии (OPT), реконструированы для создания 3D-моделей и аннотированы с использованием компьютерных инструментов сегментации в программном обеспечении Amira 3D Visualization. Аннотированный набор данных визуализируется с помощью программного обеспечения Java, JAtlasView. Пользователи нажимают на названия структур и видят их форму, положение и взаимосвязь с другими структурами в 3D-модели, а также в виртуальных 2D-сечениях.

Заключение

Атлас анатомии конечностей мыши представляет собой новый и ценный инструмент для исследователей, изучающих развитие конечностей, и может применяться в ряде областей исследований, включая идентификацию аномального строения конечностей у трансгенных линий и изучение моделей врожденных аномалий конечностей. . Используя Атлас для «виртуального» вскрытия, этот ресурс предлагает альтернативу вскрытию животных. Методы, которые мы разработали и использовали, также применимы ко многим другим модельным системам и анатомическим структурам.

Исходная информация

Мышь является часто используемой моделью для изучения развития конечностей, а анатомическое сходство конечностей мыши и человека делает ее превосходной системой для изучения дефектов конечностей человека. Преимущество мышиной модели состоит в том, что многие молекулярные методы были установлены для изучения генетических путей, регулирующих развитие конечностей, поэтому можно связать генетические механизмы с событиями формирования паттерна. Как правило, формирование паттерна конечностей изучается с помощью двумерной (2D) микроскопии всего препарата или гистологических срезов тканей или эмбрионов. Существенным ограничением этих подходов является то, что они не позволяют интерпретировать сложные физические отношения между отдельными элементами конечностей в трехмерном (3D) пространстве по мере развития. Все чаще методы трехмерной визуализации, включая оптическую проекционную томографию (OPT), эпископическую микроскопию высокого разрешения (HREM), ультразвук и ультрамикроскопию, используются для изучения эмбрионального развития и анатомии мыши и человека [1–6]. Некоторые из этих методов использовались для создания интерактивных атласов развивающихся органов и трехмерных баз данных экспрессии генов (например, EADHB [7], EMAP [8], EMAGE [9]. ], DGEMap [10], MRIMA [11] и FishNet [12]).

Недавно мы продемонстрировали, что 3D-визуализация может использоваться для изучения эмбриональной конечности мыши, предоставляя беспрецедентное количество подробной информации о формировании паттерна и росте этой структуры [13]. Трудность, с которой мы столкнулись при анализе трехмерной организации тканей конечностей, заключалась в отсутствии доступных, интуитивно понятных ресурсов для изучения взаимоотношений между структурами. Идентификация паттерна эмбриональных конечностей мышей обычно основывается на справочниках по анатомии конечностей взрослых мышей или крыс [14, 15]. Эти двумерные референсы сложно применить к трехмерным данным, и они часто не подходят для интерпретации эмбриональных структур, которые не полностью развиты или не организованы в своем окончательном взрослом образце.

Чтобы восполнить нехватку ресурсов, мы создали интерактивные 3D-модели нормальной анатомии конечностей эмбриона мыши в качестве справочного инструмента для исследователей, изучающих развитие конечностей в трансгенных моделях и моделях заболеваний. В нашем атласе представлены модели передних и задних конечностей мышей в возрасте 14,5 дней беременности, созданные с использованием OPT. Используя независимое от платформы программное обеспечение JAtlasView на основе Java [16], пользователи перемещаются по 3D-моделям конечностей, где отдельные структуры имеют цветовую кодировку и связаны с ключом анатомии. 3D-вид перекрестно связан с 2D-набором данных, где структуры с цветовой кодировкой просматриваются в ортогональных или определяемых пользователем разрезах. В отличие от текстовых атласов, наш цифровой атлас позволяет пользователям переходить от онтологии к пространственному представлению эмбриона в 3D и 2D, и наоборот. 2D- и 3D-модели включают более 60 отдельных мышц, сухожилий и костей, связанных с ключом с цветовой кодировкой. Стадия E14.5 была выбрана, поскольку это самый ранний момент времени, когда отдельные элементы конечностей, составляющие взрослую конечность, легко морфологически различимы.

Все данные и программное обеспечение могут быть загружены пользователями бесплатно. Эта база данных обеспечивает стандартизацию названий структур конечностей, используемых биологами [17]. Приветствуются отзывы о назначении аннотированных структур, простоте использования и надежности программного обеспечения, а также предложения по улучшению этого ресурса. Методы, которые мы использовали для создания базы данных, применимы к другим модельным системам и анатомическим структурам.

Конструкция и содержание

Трансгенные мыши и иммуногистохимия

Сухожилия визуализировали с репортерной линией Scleraxis(Scx)-GFP на фоне C57Bl6 [13, 18]. Эмбрионы мышей стадировали согласно Kaufman (1992) [19]. Полдень того дня, когда была обнаружена вагинальная пробка, был принят за E0,5 дня беременности. Эмбрионы собирали на E14.5, немедленно обескровливали и фиксировали, как описано ранее [13]. С эмбриональных передних и задних конечностей снимали кожу и окрашивали с использованием антител против GFP и мышечного миозина, как описано ранее [13].

Оптическая проекционная томография и сегментация

ОРТ-сканирование и 3D-реконструкция данных выполнялись, как описано ранее [13]. Цифровое сканирование образца использовалось для реконструкции «виртуальных» поперечных срезов и визуализации трехмерных изображений тканей. При работе с биологическим материалом некоторые различия в образцах неизбежны. Чтобы идентифицировать «стандартизированные» передние и задние конечности E14.5, в общей сложности было проанализировано более 75 конечностей E14.5 с использованием различных гистологических методов для анализа морфологии скелета, мышц и сухожилий. С помощью OPT-сканирования было проанализировано до 15 различных передних и задних конечностей E14.5. Репрезентативные образцы передних и задних конечностей были выбраны в качестве стандартизированных образцов для Атласа анатомии.

Реконструированные наборы данных, содержащие сканы GFP (сухожилия) и Texas-Red (мышцы) репортерных передних и задних конечностей Scx-GFP , были объединены и преобразованы в 8-битные оттенки серого для создания единого набора данных, показывающего как сухожилия, так и мышцы . Стек изображений был загружен в программное обеспечение Amira 3D Visualization (версия 3.1, Mercury Computer Systems, Германия), и структуры конечности были сегментированы и аннотированы с помощью компьютерной сегментации. Структуры были присвоены с использованием полуавтоматической сегментации. Структуры намечались вручную через каждые 10 ^-й -й разрез по оси Z и инструмент автоматического распространения в Amira использовался для нахождения границ структур между определенными разделами. Вся автоматическая сегментация была проверена вручную на точность, и при необходимости были внесены корректировки границ.

Каждый стек OPT составляет 670 пикселей по оси Z. Конечность простирается примерно на 600 пикселей в каждом стеке (эквивалентно 600 из 670 секций OPT) по оси z. Поскольку конечность E14.5 имеет длину примерно 8000 мкм, мы оцениваем толщину оптического среза примерно как 8000/600 = 13 мкм. Таким образом, размер вокселя оценивается в 13 × 13 × 13 мкм.

Эпоскопическая микроскопия высокого разрешения (HREM)

У обескровленных эмбрионов E14. 5 вырезали передние и задние конечности и обезвоживали в течение ночи в 95% этаноле. Конечности инфильтрировали полимерным раствором для заливки (набор для заливки JB-4, Polysciences, Warrington, PA), содержащим JB-4 Solution A (мономер), катализатор перекиси бензоила (12,5 мг/мл) и цветные красители Orasol black (1 мг/мл; Ciba, Маклсфилд, Великобритания), эозин B (2,75 мг/мл; Sigma, Сент-Луис, Миссури) и акридиновый оранжевый (0,55 мг/мл; Sigma, Сент-Луис, Миссури) в течение ночи при 4°C. Образцы помещали в формы с использованием раствора для пропитки с добавлением раствора JB-4 Solution B (ускоритель) для полимеризации. Образцы оставляли стоять при комнатной температуре в течение ночи. Полимеризованные блоки разрезали с помощью ВРЭМ, как описано ранее [3].

Идентификация элементов скелета, мышц и сухожилий

Кости идентифицировали по ссылкам на взрослую крысу [14] и взрослую мышь [20]. Мышцы и сухожилия идентифицировали по анатомическим эталонам взрослой крысы [14, 15, 21]. Структуры были положительно идентифицированы на основе формы, положения и ориентации по отношению к другим элементам. Сухожилия были идентифицированы как принадлежащие к определенным мышцам на основании их мышечно-сухожильных соединений. Мышцы идентифицировали на основе морфологии, а также связанного происхождения сухожилий и мест прикрепления к элементам скелета.

Во время сегментации образцов задних конечностей нам не удалось обнаружить структуру, которую можно было бы идентифицировать как прямую мышцу бедра, которая описана в одной ссылке [14], но не проиллюстрирована в другой [15]. Эта мышца расположена глубоко, поэтому маловероятно, что она была потеряна при обработке. Возможная причина, по которой мы не смогли идентифицировать прямую мышцу бедра, заключается в том, что она не является морфологически отдельным мышечным блоком у мышей E14.5.

Просмотр 3D-моделей

Наборы данных по передним и задним конечностям и JAtlasView доступны для бесплатной загрузки на нашей веб-странице (см.

раздел «Доступность и требования»). Наборы данных включают файлы форматов Woolz (.wlz) и Visualization Toolkit (.vtk) в структурированной иерархии папок (отражающей анатомию) для создания стопки реконструированных изображений и сегментированных структур конечности. Веб-страница содержит инструкции по загрузке наборов данных и программного обеспечения, а также инструкции по использованию Атласа (дополнительный файл 1). Сначала в JAtlasView открывается набор данных forelimb.wlz илиhindimb.wlz (рис. 1А). Затем загружается «Анатомическое дерево», показывающее онтологию структур (рис. 1С). Структуры организованы по областям конечностей (т. е. рука, предплечье) с подкатегориями для мышц и костей. Нажимая на названия структур, пользователи могут построить 3D-модель, показывающую выбранные мышцы, сухожилия и кости конечности в виде отдельных цветных объектов. Вращение, перемещение и увеличение модели управляются кнопками клавиатуры или мыши. «Ключ анатомии» показывает название каждой структуры в 3D-модели, ее полное имя в иерархии структур и цветовой код (рис. 1B). Цвет объекта можно изменить, щелкнув цветное поле в ключе анатомии. Чтобы выключить/включить объект в 3D-виде, щелкните значок «+/-» на ключе анатомии. Например, если пользователь хотел видеть только скелет конечности, мышцы можно отключить (рис. 2). JAtlasView работает как программа Java Network Launching Protocol (.jnlp), которая подключается к хост-серверу в HGU-MRC. Будут предоставлены обновления программного обеспечения, чтобы была загружена последняя версия. После первого запуска программы .jnlp версия программного обеспечения кэшируется на компьютере и может работать в автономном режиме.

Рисунок 1

JAtlasView. A: JAtlasView показывает интерактивную 3D-модель мышц, сухожилий и костей передней конечности эмбриона мыши на E14.5. B: Анатомический ключ. Показывает название каждой структуры в 3D-модели, ее онтогенез и цветовой код. Структуры можно включать и выключать в окне просмотра, щелкая значок «+/-» в ключе анатомии. C: Анатомическое дерево. Показывает онтогенез структур. На имена можно нажимать, чтобы структуры отображались в 3D-модели.

Полноразмерное изображение

Рисунок 2

JAtlasView, показывающий интерактивную 3D-модель скелетных структур передней конечности эмбриона мыши на E14.5 после отключения мышц и сухожилий в ключе анатомии.

Полноразмерное изображение

Просмотр 2D-моделей

3D-модель связана с серией 2D-сечений по ортогональным XY, XZ и YZ или заданным пользователем осям в разделе «Просмотр сечения» в JAtlasView. Если структуры включены в 3D виде, они определяются в разрезе (рис. 3А). Имя неопределенной структуры в разделе можно определить, выбрав «Анатомия щелчка мыши» в разделе «Показать» в 2D-окне. Затем, когда структура щелкнута в 2D-виде, ее имя появится в верхней части 2D-окна (рис. 3А). Полоса прокрутки позволяет перемещаться по стеку, а плоскость сечения видна в 3D-виде (рис. 3А и 3В). Чтобы выключить/включить объект в 2D-виде, нажмите на значки «+/-» на ключе анатомии. Для определяемого пользователем сечения «Управление» и «вращение» в средстве 2D-просмотра позволяют изменять «рыскание» и «шаг» сечения (рис. 3B). Чтобы увидеть срезы HREM передних или задних конечностей E14.5, соответствующих этапу, нажмите кнопку «изображение с высоким разрешением» в средстве 2D-просмотра (рис. 3C) и сделайте ссылку на программу просмотра срезов на основе Java, показывающую эквивалентный срез HREM (но не идентичен) разделу, созданному OPT, в средстве 2D-просмотра. Пользователи могут перемещать стрелки, чтобы перемещаться по стеку, увеличивать и переводить разделы. Хотя серия разрезов HREM не аннотирована, сравнивая разрезы с аннотированными сериями 2D, пользователи могут найти названия структур.

Рисунок 3

JAtlasView, показывающий 2D-разрез задней конечности. A: Разрез XY. С помощью функции «наведи и щелкни» средства 2D-просмотра можно щелкнуть структуры в разрезе, и название появится в верхней части 2D-окна. Плоскость сечения видна в 3D виде. B: определяемый пользователем раздел. Плоскость сечения изменяется путем регулировки «рысканья» и «тангажа». C: просмотрщик разрезов с высоким разрешением. При нажатии на «изображение с высоким разрешением» в средстве 2D-просмотра запускается Java Section Viewer. Пользователи могут перемещать стрелки, чтобы перемещаться по стеку, увеличивать и переводить разделы. Этот раздел эквивалентен разделу, показанному на 3А.

Полноразмерное изображение

Утилита

Этот ресурс предназначен для использования биологами, интересующимися анатомией конечностей, хотя мы рекомендуем другим членам научного и образовательного сообщества использовать его. В качестве 3D-инструмента Atlas полезен для сравнительной анатомии образцов, подготовленных цельными препаратами, в качестве вспомогательного средства для вскрытия и в качестве альтернативы вскрытию животных. В настоящее время большинство биологов, изучающих конечности, обычно не имеют доступа к технологии 3D-визуализации, но изучают 2D-гистологические срезы конечностей. Серия 2D-срезов Атласа позволяет пользователю сравнивать срезы мутантных конечностей с конечностями дикого типа. Регулируя плоскость сечения, пользователи могут найти точную плоскость сечения своего гистологического образца (рис. 3C). Используя функцию «укажи и щелкни», пользователи могут быстро и легко узнать названия структур и увидеть, где в 3D-модели разрезается сечение. По мере того, как 3D-визуализация становится рутинно используемой технологией, мы предполагаем, что Atlas станет все более ценным ресурсом для интерпретации 3D-данных. Кроме того, поскольку технология автоматизированной компьютерной сегментации постоянно совершенствуется [22, 23], в будущем станет возможным быстро сегментировать наборы 3D-данных мутантных конечностей для создания моделей, которые можно будет сравнивать с эталонами дикого типа.

Цель этого проекта состояла в том, чтобы предоставить свободно доступный ресурс, избегая проблем доступности, связанных с использованием некоторых печатных ресурсов и коммерческого программного обеспечения. Поскольку номенклатура структур конечностей может варьироваться в зависимости от печатных источников, дополнительной целью этого проекта является создание стандартизированной системы именования структур конечностей. Глоссарий названий мышц передних и задних конечностей, используемых в базе данных 3D, и того, как они могут отличаться в других текстовых ссылках, доступен на веб-сайте 3D Atlas.

Обсуждение и заключение

Атлас анатомии конечностей мыши — это бесплатный стандартизированный веб-справочник мышц конечностей, сухожилий и скелетных структур на 14,5-й день эмбрионального развития. Атлас содержит интерактивные и аннотированные 2D- и 3D-модели передних и задних конечностей, показывающие более 60 отдельных сегментированных структур. Это первый полный справочный инструмент для изучения эмбриональной конечности мыши и первый трехмерный атлас анатомии конечностей. Этот ресурс представляет собой новый, доступный, интуитивно понятный подход к изучению анатомии конечностей мыши, который облегчит анализ морфологии конечностей и характеристику мутантных фенотипов конечностей. Мы также ожидаем, что он станет отличным справочным пособием для широкого круга научного сообщества и особенно полезным образовательным пособием.

Мы надеемся, что по мере использования Атласа мы получим отзывы пользователей о любых расхождениях в онтологии с существующими ссылками и о том, как можно улучшить характеристики наборов данных и программного обеспечения. Мы планируем изменить 3D-атлас, где это возможно, чтобы увеличить его функциональность. В дальнейшем можно будет добавить наборы данных для разных стадий развития и модели других тканей конечности, в том числе сосудистых и нервных структур конечности.

Наличие и требования

• Название проекта: Атлас анатомии конечностей мыши.

• Домашняя страница проекта: http://www.nimr.mrc.ac.uk/3dlimb/

• Загрузка наборов данных передних и задних конечностей: http://www.nimr.mrc.ac.uk/3dlimb/downloads/

Загрузка JAtlasView: http://genex.hgu.mrc.ac.uk/Software/JavaTools/JAtlasViewer/intro. html

• Операционная система(ы): Solaris, Linux, Mac OSX. Программа просмотра может успешно работать в Windows 2000 – Internet Explorer6, Windows 2000 (установленная Java) – Internet Explorer6, Vista – Internet Explorer7, Windows XP – Internet Explorer6, Windows XP (установленная Java) – Internet Explorer7 и Firefox 2.0.

• Прочие требования: Java 1.4, Java 2 Platform Standard Edition Runtime Environment, версия 5.0 или более поздняя (J2RE)

• Любые ограничения на использование неакадемическими пользователями: Нет.

Ссылки

1. Кервин Дж., Скотт М., Шарп Дж., Пуэльес Л., Робсон С.К., Мартинес-де-ла-Торре М., Ферран Дж.Л., Фэн Г., Болдок Р., Страчан Т. и др.: трехмерное моделирование раннее развитие человеческого мозга с помощью оптической проекционной томографии. БМС Нейроски. 2004, 5: 27-10.1186/1471-2202-5-27.

   Артикул ПабМед Центральный пабмед Google Scholar

2. «>

   Шарп Дж., Альгрен У., Перри П., Хилл Б., Росс А., Хекшер-Соренсен Дж., Болдок Р., Дэвидсон Д.: Оптическая проекционная томография как инструмент для трехмерной микроскопии и исследований экспрессии генов. Наука. 2002, 296: 541-5. 10.1126/науч.1068206.

   Артикул пабмед КАС Google Scholar

3. Weninger WJ, Mohun T: Фенотипирование трансгенных эмбрионов: метод быстрого трехмерного скрининга, основанный на захвате эпископического флуоресцентного изображения. Нат Жене. 2002, 30:59-65. 10.1038/нг785.

   Артикул пабмед КАС Google Scholar

4. Розенталь Дж., Мангал В., Уокер Д., Беннетт М., Мохун Т.Дж., Ло К.В.: Быстрая трехмерная реконструкция эмбрионов с высоким разрешением с захватом эпископического флуоресцентного изображения. Врожденные дефекты Res C Embryo Today. 2004, 72: 213-23. 10.1002/bdrc.20023.

   Артикул пабмед КАС Google Scholar

5. «>

   Гонсалвес Л.Ф., Эспиноза Дж., Ромеро Р., Кусанович Дж.П., Своуп Б., Ниен Дж.К., Эрез О., Сото Э., Тредвелл М.К.: Четырехмерное УЗИ сердца плода с использованием нового томографического ультразвукового изображения. J Перинат Мед. 2006, 34: 39-55. 10.1515/JPM.2006.006.

   Центральный пабмед пабмед Google Scholar

6. Додт Х.У., Лейшнер У., Ширлох А., Ярлинг Н., Маух С.П., Дейнингер К., Деуссинг Дж.М., Эдер М., Зиггансбергер В., Беккер К.: Ультрамикроскопия: трехмерная визуализация нейронных сетей во всем мозге мыши. Нат Методы. 2007, 4: 331-6. 10.1038/nmeth2036.

   Артикул пабмед КАС Google Scholar

7. Электронный атлас развивающегося мозга человека. [http://www.ncl.ac.uk/ihg/EADHB]

8. Эдинбургский мышиный атлас. [http://genex.hgu.mrc.ac.uk]

9. Эдинбургский атлас экспрессии генов мышей. [http://genex.hgu.mrc.ac.uk]

10. Карта экспрессии генов развития. [http://dgemap.org]

11. μMRI Атлас развития мышей. [http://museatlas.caltech.edu/index.html]

12. Брайсон-Ричардсон Р.Дж., Бергер С., Шиллинг Т.Ф., Холл Т.Е., Коул Н.Дж., Гибсон А.Дж., Шарп Дж., Карри П.Д.: FishNet: онлайновая база данных анатомии рыбок данио. БМС Биол. 2007, 5: 34-10.1186/1741-7007-5-34.

    Артикул ПабМед Центральный пабмед Google Scholar

13. DeLaurier A, Schweitzer R, Logan M: Pitx1 определяет морфологию мышц, сухожилий и костей задней конечности. Дев биол. 2006, 299: 22-34. 10.1016/j.ydbio.2006.06.055.

    Артикул пабмед КАС Google Scholar

14. Чейс Грин Э: Анатомия крысы. 1963, Нью-Йорк: Hafner Press

    Google Scholar

15. «>

    Hebel RS, MW: Анатомия и эмбриология лабораторной крысы. 1986, Вортзее: BioMed Verlag

    Google Scholar

16. Feng G, Burton N, Hill B, Davidson D, Kerwin J, Scott M, Lindsay S, Baldock R: JAtlasView: программа просмотра атласов Java для просмотра биомедицинских 3D-изображений и атласов. Биоинформатика BMC. 2005, 6: 47-10.1186/1471-2105-6-47.

    Артикул ПабМед Центральный пабмед Google Scholar

17. Бургер А., Дэвидсон Д., Болдок Р.: Формализация анатомии эмбриона мыши. Биоинформатика. 2004, 20: 259-67. 10.1093/биоинформатика/btg400.

    Артикул пабмед КАС Google Scholar

18. Прайс Б.А., Брент А.Е., Мерчисон Н.Д., Табин С.Дж., Швейцер Р.: Создание трансгенных репортеров сухожилий, ScxGFP и ScxAP, с использованием регуляторных элементов гена склераксиса. Дев Дин. 2007, 236: 1677-82. 10.1002/двды.21179.

    Артикул пабмед КАС Google Scholar

19. Кауфман М. Атлас развития мышей. Переработанное издание изд. 1992, Лондон: Academic Press

    Google Scholar

20. Ясуда М.Ю., Т.: Цветовой атлас скелета плода мыши, крысы и кролика. 1996, Осака: Хакушинша

    Google Scholar

21. Мразкова О., Дылевский И.: Подошвенный напрягатель апоневроза – новая мышца в конечности крысы. Фолиа Морфол (Прага). 1971, 19: 352-357.

    КАС Google Scholar

22. Кейтс Дж. Э., Уитакер Р. Т., Джонс Г. М.: Тематическое исследование: оценка иерархической сегментации водораздела с помощью пользователя. Мед имидж анал. 2005, 9: 566-78. 10.1016/j.media.2005. 04.007.

    Артикул пабмед Google Scholar

23. Лин Г., Адига У., Олсон К., Гузовски Дж. Ф., Барнс К. А., Ройсам Б.: Гибридный трехмерный алгоритм водораздела, включающий признаки градиента и модели объектов для автоматической сегментации ядер в стеках конфокальных изображений. Цитометрия А. 2003, 56: 23-36. 10.1002/cyto.a.10079.

    Артикул пабмед Google Scholar

Скачать ссылки

Благодарности

Этот проект финансировался MRC, Великобритания. Мы благодарим G. Feng за помощь с JAtlasView и подготовкой наборов данных, R. Schweitzer за предоставление трансгенной линии Scx-GFP , J. Sharpe за помощь с OPT и P. Walker за помощь в настройке компьютера Linux. Помощь в работе с животными оказывали сотрудники отделов биологических служб НИМР. Мы благодарны П. Валасеку за то, что он выступил в роли «подопытного кролика» и предоставил обратную связь. Наша веб-страница была создана C. McGuire (NIMR).

Информация об авторе

Авторы и организации

1. Отдел биологии развития, Национальный институт медицинских исследований, Риджуэй, Милл-Хилл, Лондон, NW7 1AA, Великобритания

   Эйприл ДеЛорье, Майкл Беннетт, Тимоти Дж. Мохан и Малькольм ПО Логан

2. Институт неврологии, 1254 Орегонский университет, Юджин, Орегон, 97403, США

   Эйприл ДеЛорье

3. Отдел генетики человека MRC, Западная больница общего профиля, Крю Роуд, Эдинбург, Эх 5 2XU, Шотландия, Великобритания

   Николас Бертон, Ричард Болдок и Дункан Дэвидсон

Авторы

1. Апрель ДеЛорье

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

2. Николас Бертон

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

3. Майкл Беннетт

   Посмотреть публикации автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

4. Richard Baldock

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

5. Duncan Davidson

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

6. Timothy J Mohun

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Академия

7. Malcolm PO Logan

   Просмотр публикаций автора

   Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar

Автор, ответственный за переписку

Малкольм ПО Логан.

Дополнительная информация

Вклад авторов

AD подготовила, отсканировала, сегментировала данные конечностей и реконструировала серию секций HREM. NB и RB внесли улучшения в программное обеспечение JAtlasView. RB преобразовал наборы данных в форматы Woolz и vtk. NB сгенерировал набор данных Java Section Viewer. ДД внес предложения по внедрению Атласа и помог координировать взаимодействие между NIMR и HGU-MRC. TM настроил систему сканирования OPT и программное обеспечение для реконструкции. МБ выполнил HREM секционирование. ML является главным куратором этого проекта и соответствующим автором обратной связи онлайн-ресурса. Все авторы прочитали и одобрили окончательный вариант рукописи.

Электронный дополнительный материал

12861_2008_367_MOESM1_ESM.mov

Доп. файл 1: 3dlimbatlasdemo. Видео в формате Quicktime, демонстрирующее навигацию и использование трехмерного атласа анатомии конечностей. (MOV 514 КБ)

Оригинальные файлы изображений, представленные авторами

Ниже приведены ссылки на оригинальные файлы изображений, представленные авторами.

Авторский файл рисунка 1

Авторский файл рисунка 2

Авторский исходный файл для рисунка 3

Авторский оригинальный файл для рисунка 4

Права и разрешения

Открытый доступ Эта статья опубликована по лицензии компании BioMed Central Ltd. Эта статья находится в открытом доступе и распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License ( https://creativecommons.org/licenses/by/2.0 ), который разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии надлежащего цитирования оригинальной работы.

Перепечатки и разрешения

Об этой статье

Выход на конечность: анатомия верхней конечности

Этот курс заархивирован

Посмотреть материалы курса

Я хочу получать электронные письма от PennX и учиться о других предложениях связанный с выходом на конечность: анатомия верхней конечности.

Об этом курсе

Чему вы научитесь

Преподаватели

edX For Business

6 недель

2–3 часа в неделю

Под руководством инструктора

Под руководством инструктора по расписанию курса

Этот курс находится в архиве

Просмотреть материалы курса Выход на конечность: анатомия верхней конечности.

Выход на конечность: анатомия верхней конечности

Лаборатория анатомии больше не предназначена только для студентов-первокурсников-медиков. С помощью этого онлайн-курса анатомии каждый может узнать о верхней конечности без трупа.

Этот курс послужит вам введением в анатомию верхней конечности. Мы начнем с базовой человеческой анатомической терминологии и применим эти знания к изучению костей верхней конечности и того, как они сочленяются в суставах. Вы также узнаете о мышцах, которые производят движение в этих суставах в дополнение к иннервации и кровоснабжению верхней конечности.

Кратко

• Учреждение: PennX
• Предмет: Медицина
• Уровень: Вводный
• Требования:

  Нет

• Язык: английский
• Расшифровка видео: английский
• Дополнительные навыки: Анатомия

• Анатомический термин ология
• Кости и мышцы верхней конечности
• Действия каждой мышцы верхней конечности
• Иннервация и кровоснабжение верхней конечности

Неделя 1 – Язык анатомии

• Обзор
• Анатомическая терминология и отделы конечностей
• Остеология и скелетная анатомия; Мышечные действия
• Мышечные крепления; Самолеты движения

 
Неделя 2.