Петлях trx: Официальный сайт TRX в России. Купить петли TRX для функционального тренинга, аксессуары для фитнеса. TRX Russia.

Логотип

TRX Tron Coin на полнокадровом бл… | Stock Video

Сэкономьте до 20% на первом заказе •
Применить HELLO20

Похожие запросы

майнинг биткойнов портфель деньги криптовалюта финансы анимация деловая графика цифровые деньги рыночные данные бизнес праздновать Зарабатывать

Похожие категории

• логотип,
• баннер,
• криптовалюта,
• флаги,
• блокчейн,
• валюта,
• шифрование,
• монеты,
• трон,
• петля,
• рама,
• черный,
• фоны,
• финансовый,
• электроника,
• концепция,
• финтех,
• значение,
• инвестиции,
• финансы

Как тиоредоксин диссоциирует свой смешанный дисульфид

Рисунок 1.

В структуре смешанного дисульфидного комплекса Trx-ArsC образуется функционально ключевой дисульфид между Cys29 ^Trx и Cys89 ^ArsC .

Комплекс Bs_Trx-ArsC (2IPA) с боковыми цепями остатков Cys29 ^Trx , Cys32 ^Trx , Trp28 ^Trx , Arg16 ^ArsC , Cy показаны s82 ^ArsC и Cys89

ArsC в виде палочек . α1-спираль Trx показана синим цветом; зацикленная окислительно-восстановительная спираль ArsC между Cys82 ^ArsC и Cys89 ^ArsC розового цвета.

Подробнее »

Расширять

Фигура 2.

Bs_Trx восстанавливает Bs_ArsC через промежуточный комплекс Trx-ArsC.

A Cys29 ^Trx восстановленного Bs_Trx (2GZY) нуклеофильно атакует Cys89 ^ArsC Cys82 ^ArsC -Cys89 ^{ArsC 90 057 дисульфид окисленного Bs_ArsC (1Z2E), приводящий к образованию смешанного Cys29 Trx -Cys89 ArsC дисульфид (2IPA). ( B и C ) Cys32 Trx выполняет нуклеофильную атаку на Cys29 Trx}

, что приводит к высвобождению восстановленного Bs_ArsC (1Z2D) и окисленного Bs_Trx (2GZZ).

Подробнее »

Расширять

Рисунок 3.

Экспериментальные pKa коррелируют с рассчитанным зарядом NPA.

Получена калибровочная кривая NPA-заряд-pKa (черные кружки) A для ряда малых молекул тиолата (экспериментальные pKa получены из ссылки [74]) и B для ряда цистеиновых остатков систем Trx и ArsC. Точки данных калибровочной кривой B (a–g) сведены в таблицу S1 в дополнительных данных, а также указаны на кривой A. трифторметантиол (1), метантиол (2), меркаптоэтанол (3), цистеин (4), трифторэтантиол. (5), бензолметантиол (6) и тиоуксусную кислоту (7). Cys89 S. aureus ArsC (а), Cys77 B. subtilis resA [75], [76] (б), Cys10 S.

aureus ArsC (в), Cys32 E. coli Trx1 [24] (г), Cys29 S. aureus P31T C32S Trx1 [9] (д), Cys73 R. capsulatus Trx2 [77] (е) и Cys35 E. coli Trx1 [24] (ж).

Подробнее »

Расширять

Рисунок 4.

Модельные системы комплекса Bs_Trx, Bs_ArsC и Bs_Trx-ArsC для анализа pKa и реактивности.

A Уменьшенный Bs_Trx (2GZY), смоделированный активным центром Trp28 ^Trx -Cys32 ^Trx и α1-спиралью Lys33-Glu45 (синий). B Окисленный Bs_ArsC (1Z2E), представленный окислительно-восстановительной спиралью Cys82 ^ArsC -Cys89 ^ArsC (ArsC_ox). C Модель Bs_Trx-ArsC (Trx_ArsC_1), в которой отсутствуют взаимодействия водородных связей ни с Cys32 ^Trx

, ни с Cys82 ^ArsC , представленная Trp28 ^Trx -Cys32 ^Trx Trx активный сайт и Cys82 ^ArsC -Cys89 ^ArsC ArsC окислительно-восстановительная спираль (розовая) и Thr11 ^ArsC . D Модель Bs_Trx_ArsC (Trx-ArsC_2), в которой Cys82 ^ArsC S _{γ ​​} —Arg16 ^ArsC N _η1 и Cys32 ^Trx S _{γ ​​} —Cys29 ^Trx N водородные связи присутствуют. Активный сайт Trp28 ^Trx -Cys32 ^Trx Trx и Cys82 ^ArsC -Cys89 ^ArsC ArsC окислительно-восстановительная спираль (розовая) и Thr11 ^ArsC и Arg16 ^ArsC включены. E Trx_ArsC_1_trunc и Trx_ArsC_2_trunc модельные системы, включая Trp28 ^Trx -Cys32 ^Trx активный сайт Trx и Cys89 ^ArsC ArsC. F Системы моделей Trx_ArsC_2_trunc+helix и Trx_ArsC_1_trunc+helix, включая все, что описано в ( E. ) и Trx Lys33 ^Trx -Glu45 ^Trx α1-helix (синий).

Подробнее »

Расширять

Таблица 1.

pKa тиолов количественно рассчитывают через их соответствующие заряды NPA.

Подробнее »

Расширять

Таблица 2.

Анализ реакционной способности образования комплекса Bs_Trx-ArsC: сопоставление локальной мягкости.

Подробнее »

Расширять

Таблица 3.

Анализ реакционной способности образования комплекса Bs_Trx-ArsC: мягкость и функция Фукуи.

Подробнее »

Расширять

Рисунок 5.

Водородная связь Cys32 ^Trx в смешанном дисульфиде Bs_Trx-ArsC.

Временная динамика в моделировании МД расстояния между A Cys32 ^Trx S _{γ ​​} и Trp28 ^Trx N и между B Cys32 ^Trx S _{γ ​​} и Cys29 ^Trx N, с ионизированным (черный) и нейтральным (красный) Cys82 ^ArsC . C Пример одного снимка MD с Cys32 ^Trx S _{γ ​​} —Cys29 ^Trx N и Cys32 ^Trx S _{γ ​​} —Trp28 900 56 Trx N водородные связи вводятся при депротонировании Cys82 ^ArsC .

Подробнее »

Расширять

Таблица 4.

Анализ реактивности диссоциации комплекса Bs_Trx-ArsC: соответствие мягкости.

Подробнее »

Расширять

Таблица 5.

Анализ реактивности диссоциации комплекса Bs_Trx-ArsC: мягкость и функция Фукуи.

Подробнее »

Расширять

Рисунок 6.

Конформационное изменение приносит Cys32 ^Trx в контакте с Cys29 ^Trx .

Изменение расстояния между Cys29 ^Trx S _{γ ​​} и Cys32 ^Trx S _{γ ​​} (красный) и Cys 32 ^Trx S _{γ ​​} и Trp28 ^Trx N ( A , черный) и Cys32 ^Trx S _{γ ​​} и Cys29 ^Trx N ( B , черный). C Наложение активного сайта Trx (Trx28 ^Trx -Cys32 ^Trx ) и окислительно-восстановительной спирали ArsC (Cys82 ^ArsC -Cys89 ^ArsC ) комплекса Bs_Trx-ArsC при 0 нс (фиолетовый) и 14,5 нс ( зеленый) время моделирования, показывающее связанное конформационное изменение с приближением Cys32 ^Trx к Cys29 ^Trx во время моделирования MD (ионизированный Cys82 ^ArsC ).

Подробнее »

Расширять

Рисунок 7.

Цис32 ^Trx готов к нуклеофильной атаке в активированном комплексе Trx-ArsC.

Избранные снимки из МД моделирования комплекса Trx-ArsC (ионизированный Cys82 ^ArsC ), представляющие структурную основу активации Cys32 ^Trx (зеленый углерод, шарики и палочки) для его нуклеофильной атаки на Cys29 ^Trx . На этих снимках Cys32 ^Trx S _{γ ​​} связан водородной связью (пурпурные пунктирные линии) с амидными NH-группами обоих Trp28 ^Trx и Cys29 ^Trx . Кроме того, атомы серы Cys32 ^Trx и Cys29 ^Trx находятся в пределах 4,5 Å друг от друга. Водородные связи удовлетворяют геометрическим критериям: Cys32 ^Trx S _{γ ​​} —Trp28 ^Trx N≤4 Å и Cys32 ^Trx S _{γ ​​} —Cys29N ^{Trx 9 0057 ≤4 Å, с соответствующими углами между S _γ , а векторы N−H составляют ≥150 градусов. Водородные связи, переданные сере Cys32 Trx , снижают ее pKa до 7,4 (табл. 4), что соответствует значительной популяции тиолатной формы Cys32 Трх . Этот тиолат, близкий к Cys29 Trx , фактически готов к нуклеофильной атаке на Cys29 Trx (черная стрелка). В сочетании с вспомогательным анализом реакции, расчетами pKa и экспериментами по образованию комплекса (основной текст) показанные здесь конформации и взаимодействия предлагаются для подтверждения механизма диссоциации комплекса Tx-ArsC.}

Подробнее »

Расширять

Таблица 6.

pKa тиолов в активированном комплексе в разные моменты времени моделирования МД.

Подробнее »

Расширять

Рисунок 8.

Вернемся к предполагаемой роли Asp23 ^Trx в депротонировании Cys32 ^Trx .

A Вода иногда предлагается для содействия депротонированию Cys32 ^Trx с помощью Asp23 ^Trx . Положение молекулы воды в комплексе Bs_Trx-ArsC получено моделированием. B Оценка образования комплекса Sa_Trx-Sa_ArsC ^Trip дикого типа и Sa_Trx D23A-Sa_ArsC ^Trip на невосстанавливающем SDS-PAGE (pH 7,5). Стабильный комплекс не обнаружен. (1. Sa_Trx+Sa_ArsC ^Trip ; 2. Sa_Trx D23A+Sa_ArsC ^Trip 3. Полоса положительного контроля комплекса Sa_Trx-ArsC [1]). ( C. ) Обращенно-фазовый анализ продуктов реакции после образования комплекса между Sa_Trx D23A и ​​Sa_ArsC ^Trip .